havoc писал(а):насколько хорошо оптимизирован сервер БД
можно судить только зная паттерн нагрузки. Иначе все предоставленные вами данные - не более чем цифры.
havoc писал(а):ресурс диска не исчерпан иначе бы i/o wait в top был высоким
Во-первых, учитывая кеширование самим контроллером, диском и ОС, этот показатель нередко показывает температуру на Марсе. Во-вторых, ресурс диска - это не только очередь запросов к нему, но еще и скорость обработки некоторых запросов (в особенности - на операциях с мелкими файлами), из-за которой всего одна из сотни операций может выполняться как минимум столько же, сколько и 99 остальных. Ну а когда таких операций много в единицу времени? Тем более вон у вас там лефтджоины...
Самые проблемные запросы к диску - это "суб-4к" - в кеш помещаются сотнями, а вот скорость выполнения (это общая проблема, даже у SSD тут просадка) - хромает.